中国现行土地征用程序究竟有什么缺陷？
首先是批准制不太合理.按照有关规定，对规划确定的建设用地，实行分批征用，分批征用。主要表现在：一是容易造成重复审批，土地利用规模难以控制，违法用地难以监督；其次，一份报批文件包含多个建设项目或用地的征用资料及图件，且各项目前期准备进度可能并不一致，容易导致建设项目用地审批时间过长，降低审批效率，也不利于后续项目管理，不利于土地档案资料的查询及调取。
其次，土地征用审批时间较长。按照现行规定的办卷时限，市、县土地行政主管部门组织报批材料的时间是1个月，市级土地行政主管部门审查的时间是5天，省级土地行政主管部门的审查期是10到15天，将各级政府的审查会签考虑在内，待批准征用转用，一般需要3个月。在批后实施中，市、县在接到征地批准文件后，10个月内就会进行第一次公告，在公告之日起的45日内，制订土地补偿安置方案，并予以公告。除此之外，被征地单位及其成员办理补偿登记的时限一般为15天左右，整个从组织报批到完成征地过程，大概需要将近半年的时间。由于各地争取项目的难度很大，许多地方只能打“擦边球”，一边开工一边办理审批手续，有时项目投产几年了，审批文件还没拿到。
第三，“二公告一登记”的程序设置不合理；主要表现为：一、二公告一登记程序设置滞后；我国现行的征地程序是在征地批准后进行“两公告一登记”，而在征地预公告时就已经根据当时的现状确定了补偿登记，在征地批后再进行征地补偿登记和征地补偿安置公告，这种做法忽略了农民的知情权，有悖于当前征地工作所倡导的“公众参与，充分尊重农民合法权益”的理念。在实际操作过程中，被征地农村集体经济组织和农民是征地过程中的一方，征地方在征地前没有履行告知义务，使农民没有知情权、参与权，不知道“补什么、补多少、失地后生产生活如何保障”等关系到自身生存与发展的重要问题，而只是在事后进行公告，这就很容易引起争议，甚至发生群发事件，对征地工作的正常进行造成影响。其次，由于“两公告”在内容上存在差异，单独进行会增加不必要的行政手续，影响行政效率；最后，对公告后的《被征用农民的补偿登记》的规定，在实际操作中很难操作。
第四，土地征用听证程序的不完善；在过去几年的工作实践中，由于听证这种形式具有客观公正、公开透明、程序规范、事实清楚等优点，因此它获得了很大的进步与发展，并逐渐为社会所接受。然而，它仍然存在着一些问题，例如：制度建设不够完善，公开程度不够，农民参与度不够，监督措施不够。听证程序繁琐、耗时过长，不利于提高土地征收的公平性和公平性。如果建设项目涉及到土地利用总体规划的修改，则需要在一个项目审批程序中对同一内容进行两次听证，耗时约60天，耗时过长，影响项目进度。
第五，土地征用报批手续繁杂。在项目审批的过程中，需要准备近20份材料，包括报告和图纸，每一份都不能少，每一份材料的重量都在几十公斤以上。这不仅需要大量的准备工作，而且容易产生浪费。